Do 2021 r. obowiązywały przepisy zwalniające z podatku nieruchomości kolejowe udostępniane przewoźnikom. Spór dotyczy jednak tego, czy ulga obejmowała całe działki, czy tylko ich faktycznie wykorzystywaną część.

W latach 2017–2021 obowiązywały przepisy przewidujące zwolnienie z podatku od nieruchomości dla gruntów, budynków i budowli udostępnionych przewoźnikom kolejowym. Zwolnienie to obejmowało całą infrastrukturę kolejową – także grunty, które tylko częściowo były wykorzystywane na potrzeby kolejnictwa. Praktyka ta wzbudziła jednak wątpliwości organów podatkowych i sądów, zwłaszcza w sytuacjach, gdy działki były duże, a elementy kolejowe zajmowały jedynie marginalną ich część.

Problem dotyczył m.in. tego, czy zwolnienie dotyczyło całej działki, czy wyłącznie jej fragmentu wykorzystywanego pod infrastrukturę. Wątpliwości te doprowadziły do interwencji Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej, który w wyroku z dnia 29 kwietnia 2025 r., o sygn. akt C-453/23 uznał, że przepisy te nie stanowią niedozwolonej pomocy publicznej. Tym samym potwierdzono zgodność ówczesnych regulacji z prawem unijnym.

Jednak problem pozostaje – NSA nadal rozstrzyga, czy zwolnienie miało charakter całościowy, czy ograniczony – szczególnie w kontekście przypadków potencjalnego nadużywania preferencji poprzez celowe scalanie działek.

Postanowienie Naczelnego Sądu Administracyjnego z 02.09.2025 r., o sygn. akt III FSK 1020/23.