Od momentu wejścia w życia KSeF, przedsiębiorcy podczas opłacania faktur ustrukturyzowanych będą zobowiązani do wskazania w komunikacie płatności numeru KSeF lub identyfikatora zbiorczego faktury. Istnieją jednak pewne wyjątki. Zgodnie z interpretacją indywidualną z dnia 4 grudnia 2025 roku, sygn. akt 0113-KDIPT1-2.4012.882.2025.1.AJB Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej potwierdził, iż przedsiębiorcy dokonujący transakcji z zagranicznymi kontrahentami niebędącymi polskimi podatnikami VAT nie będą mieli takiego obowiązku z uwagi na status podatkowy zagranicznego kontrahenta w Polsce.